實驗室通風系統對通風柜有一定標準和要求的。拋開設備因素，單純從系統設計上考慮，實驗室通風空調系統的設計要考慮以下幾個主要因素：

1.系統穩定可靠。

2.保證實驗室的安全性，保證一定數量的換氣次數。

3.在滿足換氣次數和全新風條件下，控制能耗。

4.解決實驗室通風系統負壓的設計和系統控制。

通風柜的選擇除了滿足排風和捕捉能力外，還要注意需要根據調節門移動而立即改變風量，維持表面風速的恒定。因為通風系統不平衡會導致通風柜排風和捕捉能力散失，氣流流出實驗室，建筑物內壓力不穩定。
此外，系統風量的變化不會因為風管內靜壓的變化而使得反應時間緩慢影響系統流量的精確性。壓力相關型的系統也會造成系統流量設備無法進行精確控制，緩慢的反應時間會讓送排風設備產生震蕩，速度不穩定會有大量的平衡問題存在，波動的系統使氣流平衡復雜化，就會導致自控系統無法實現調節功能。