1.I型生物安全柜（Class I）
I型生物安全柜為操作人員提供保護，但對于樣品的保護作用較弱。其工作原理是空氣從柜外吸入，并通過濾網（如HEPA過濾器）過濾后排放到實驗室環境中。雖然此類安全柜能夠防止病原微生物對操作人員的暴露，但由于缺乏對樣品的隔離措施，因此在要求較高的實驗中應用受限。
適用范圍： 主要用于低風險、非致命性微生物樣本的分析和處理。常見于公共衛生研究、基礎生物學實驗等。
優點：操作簡單，價格相對較低。高效保護操作人員免受微生物暴露。
缺點：無法提供對樣品的保護，可能導致樣品污染。不適用于高危生物樣本的操作。
2.II型生物安全柜（Class II）
II型生物安全柜常用于大多數需要保護操作人員、環境和樣品的實驗室。其氣流設計包括進入工作區的垂直氣流和從工作區排放的空氣流。該類型的安全柜通過高效過濾系統，不僅能夠保護操作人員免受病原體暴露，還能有效防止外部環境污染樣品。
適用范圍： II型生物安全柜廣泛應用于微生物學、細胞生物學、醫學、病毒學、藥物研發等實驗中，尤其適用于處理高風險和高致病性樣本。
優點：同時為操作人員、環境和樣品提供保護。通常配有負壓空氣流動，避免有害氣體和微生物泄漏。適用于多種生物樣本的分析和處理。
缺點：價格較I型高。需要定期維護和更換過濾器。
3.III型生物安全柜（Class III）
III型生物安全柜提供最高級別的保護，特別適合處理致命性病原體和極具危害性的生物樣本。其設計特點是使用密封的柜體和專用的手套，操作人員通過手套進行樣品處理，避免直接接觸病原體。這類安全柜的氣流設計通過全封閉系統來提供最大的安全性，排放的氣流經過多級過濾，確保對外部環境完全隔離。
適用范圍： III型生物安全柜常用于處理非常危險的病原體、病毒或高度危險的生物樣本，通常應用于生物安全實驗室。
優點：提供極高的安全保護，適用于處理致命性病原體。嚴密的密封設計，完全隔離操作人員與病原體。
缺點：操作復雜，需要操作人員具備專業技能。價格昂貴，適用于高安全性實驗環境。